Тайная история COVID-19: происхождение коронавируса и его распространение по миру

Тайная история COVID-19: происхождение коронавируса и его распространение по миру

Согласно  документам , полученным U.S. Right to Know из национального архива США, американские ученые планировали сотрудничать с Уханьским институтом вирусологии для создания новых коронавирусов с признаками SARS-CoV-2 за год до появления вируса в этом городе.

Ученые, разделенные по поводу так называемой «лабораторной утечки» и гипотез естественного происхождения, в течение нескольких лет размышляли над загадочным языком американо-китайского исследовательского проекта “ DEFUSE ”, описывающего эксперименты по усилению функций (Gain of Fuctuion Research) коронавирусов. Заявка на грант DEFUSE была подана президентом Eco Health Alliance Питером Дашаком. Черновики и заметки, полученные по запросу согласно Закону о свободе информации США, раскрывают новые подробности о предполагаемом исследовании. В частности, ученые стремились внедрить сайты расщепления фурина на стыке S1 / S2 белка-шипа; собрать синтетические вирусы из шести сегментов; идентифицировать коронавирусы, на 25% отличающиеся от SARS; и выбрать для связывания с рецепторами домены, способные поражать рецепторы человека. Геном SARS-CoV-2, вируса, вызывающего COVID-19, соответствует вирусам, описанным в предложении по исследованию:

SARS-CoV-2 имеет сайт расщепления фурина, расположенный в белке-шипе на стыке S1 / S2. Место расщепления фурина превратило вирус в наихудший пандемический патоген за столетие. Вирусологам еще предстоит идентифицировать его в любом другом родственном коронавирусе.

Геном SARS-CoV-2 можно разделить на шесть смежных фрагментов с помощью ферментов рестрикции Bsal и BsmBI. Эти ферменты рестрикции встречаются в природе, но также могут быть использованы в лаборатории для сращивания вирусов. Трио ученых в  анализе 2022 года  подсчитали, что вероятность увидеть образец, обнаруженный при SARS-CoV-2, в природе будет  незначительной . Заказы покупку одного из этих ферментов, BsmBI, можно найти в документах.

SARS-CoV-2 сразу оказался высокоинфекционным и не сильно эволюционировав у людей. Вирус  «вышел из коробки, готовый к заражению». Домен, связывающий рецептор ACE2, оказался «точно настроенным» на человеческий рецептор ACE2, но при первом распространении на людей имел небольшие генетические вариации, представляя сложный  «парадокс»  для вирусологов, которые пытались доказать, что он возник естественным путем. Документы подтверждают, что ученые, работающие с уханьской лабораторией, стремились в своих исследованиях отобрать домены, связывающие рецепторы, которые хорошо связываются с человеческим ACE2.

  Геном SARS-CoV-2 находится в пределах  25-процентного генетического отличия  от SARS.

Связанные вопросы и ответы:

Где был обнаружен первый случай COVID-19

Ряд теорий о том, как мог появиться вирус, были отвергнуты. Большинство из оставшихся попадают под 3 возможных сценария:

• Вирус развился естественным путем, но сотрудник лаборатории заразился от образца и случайно «пронес» его в сообщество.
• Ученые лаборатории манипулировали образцами вируса и случайно или намеренно выпустили патоген.

Что делает происхождение вируса таким обсуждаемым, так это то, что различные его мутации и изучаемые фрагменты трудно объяснить. Хотя большинство вирусологов заявили, что коронавирус, вероятно, эволюционировал по своей природе, они согласились с тем, что разумно изучить возможность того, что он пришел из лаборатории. В основе этих подозрений лежит Уханьский институт вирусологии – исследовательский центр, основанный в 1950-х годах, который первым в Китае получил разрешение на высочайший уровень биобезопасности. Лаборатория института имеет уровень биобезопасности 4 (известный как BSL-4, самый высокий уровень). Это означает, что она оборудована для изучения самых опасных в мире инфекционных агентов и токсинов, которые требуют строжайших мер биологической сдержанности. Именно это обозначение и расположение лаборатории в городе, где впервые было сообщено о вспышке, сделали институт одним из первых подозреваемых.

Однако ученые говорят, что хотя утечка в лаборатории вероятна, это не обязательно означает, что это наиболее вероятное объяснение. Более вероятно, что вирус передался людям от животного, такого как летучая мышь. Опыт проведения полевых эпидемиологических исследований птичьего гриппа во Вьетнаме с 2008 по 2016 год показал, насколько тесный контакт с дикой природой, например, на «влажных рынках» по всему миру, где в уличных киосках продают мясо, морепродукты и живых животных для употребления в пищу, могут создавать легкие возможности для проникновения патогенов в человеческое население.

Происхождение от животных рассматривается как основная версия. Первый случай инфекции Covid-19 был прослежен до рынка морепродуктов Хуанань в Ухане, что привело к предположениям о том, что, возможно, это было место, где вирус перешел от животных к людям. Но с тех пор китайские исследователи обнаружили, что несколько из самых ранних известных случаев Covid-19 в городе не были связаны с рынком, а это означает, что вирус, возможно, уже распространялся в сообществе.

Совместное расследование Всемирной организации здравоохранения и Китая было сосредоточено на возможности зоонозного или животного происхождения. Отчет команды показал, что вирус, вероятно, появился у летучих мышей и перешел на промежуточное животное, прежде чем он распространился на людей.

Как коронавирус распространился из Китая по всему миру

Ещё в мае 2020 года учёные из Вашингтонского университета изучили особенности распространения CoViD-19 в России. Тогда учёные предположили, что "корону" в Россию завезли не из Китая, который до сих пор считается отправной точкой глобальной пандемии, а из стран Европы. География распространения CoViD-19 пока не позволяет сказать, как именно и в какой точке земного шара началась пандемия, однако для общего понимания ситуации эти данные крайне важны.

Существующая схема развития пандемии, которая до сих пор хранится на сайте ООН , подтверждается каждый раз, когда миру угрожает серьёзная инфекция. Однако шесть этапов, переход через которые может стать причиной для объявления пандемии, в случае с CoViD-19 могли быть пройдены существенно раньше. Отличие коронавируса от эпидемий птичьего и свиного гриппа состоит в том, что нулевой пациент ошибочно выявлялся в нескольких регионах мира. Изначально нулевым пациентом считался сотрудник секретной лаборатории института вирусологии в городе Ухань, затем посетитель рыбного рынка в том же городе.

Однако через два месяца после начала пандемии сотрудники университетской больницы в Париже обнаружили частицы вируса SARS-CoV-2 в замороженном образце мокроты, пробы которой были взяты ещё в декабре 2019 года. С учётом того, что симптоматика и клинические проявления коронавируса на тот момент были изучены слабо, учёные предположили, что нулевой пациент мог заразиться инфекцией ещё в ноябре, то есть до официального начала пандемии в КНР. Получается, китайцы стали жертвой пандемии точно так же, как и весь мир?

Что известно о первоначальном источнике коронавируса

Согласно данным Всемирной организации здравоохранения, первого пациента с симптомами COVID-19 выявили 8 декабря 2019 года , а большинство случаев заболевания имели связи с рынком морепродуктов в Ухане китайской провинции Хубэй, который 1 января 2020 года закрыли – в то же время людей с клиническими проявлениями инфекции изолировали. С 15 января властям Уханя поручили прекратить массовые мероприятия и начать проверку температуры пассажиров в аэропортах, на автобусных и железнодорожных станциях. Пять дней спустя в Ухане и всей провинции Хубэй объявили строжайший карантин и приступили к строительству временных больниц для зараженных.

Работа велась очень активно. В частности, за десять дней – с 24 января по 2 февраля – 7500 рабочих построили больницу «Хошэньшань» на 1000 койко-мест по типу пекинского госпиталя «Сяотаньшань». За 12 дней была построена больница «Лэйшэньшань» на 1600 койко-мест, а стадионы и экспозиции были превращены в 16 модульных больниц на 14 тысяч койко-мест.

Несмотря на жесткие меры, действовавшие более двух лет, новой вспышки инфекции не удалось избежать. С 4 по 20 февраля 2022 года в КНР проходили Зимние Олимпийские игры. В преддверии и во время соревнований заразилось более 400 гостей и связанных с Олимпиадой граждан Китая. Через две недели началась новая, очень мощная волна распространения инфекции в Китае, хотя летальные случаи были единичными. В связи со вспышкой в конце марта был закрыт 25-миллионный Шанхай.

В России с 20 февраля 2020 года был введен запрет на въезд на территорию страны граждан Китая. 2 марта 2020 года был выявлен первый случай заболевания в Москве. Российский турист, вернувшийся из Италии, был помещен на карантин в инфекционный бокс. А уже 11 марта Россия впервые начала серьезно ограничивать авиасообщение со странами ЕС. С 30 марта страна полностью закрыла свои границы как для россиян, так и для иностранных граждан .

Как быстро начали появляться новые случаи COVID-19 в Китае

3 марта 2020 года из Испании пришла новость, которой многие не придали большого значения. Сообщалось, что в стране признана первая смерть от коронавируса,ретроспективного исследования.Власти Валенсиичто еще 13 февраля от тяжелой пневмонии неизвестного происхождения умер мужчина 69 лет, вернувшийся из путешествия в Непал. Повторное вскрытие, проведенное после изменения Минздравом критериев поиска зараженных 27 февраля, дало положительный анализ на COVID-19. К этому моменту в регионе Валенсия числились 19 больных. На 27 марта их было уже 3,2 тыс., 167 умерли.

В Италии, где так и не удалось определенно установить, от кого же заразился самый первый непривозной пациент, 38-летний Маттиа из Кодоньо, самые разные данные указывают на более раннюю циркуляцию вируса. Вирусологи из Университета Милана и миланского госпиталя Сакко утверждают, что картирование генома указывает на присутствие СOVID-2019 в Италии. С этим согласуются данные медицинской статистики: нетипичные вспышки тяжелой пневмонии врачи. Наконец, свежее детальное исследование лабораторных образцов в сочетании с опросом пациентов надежно устанавливает, что, в день постановки диагноза первому больному, вирус циркулировал в Южной Ломбардии. Происхождение болезни самого Маттиа изучали с помощью филогенетического исследования вирусного генома. Дело в том, что вирус постоянно мутирует и, изучая геном вирусов, взятых у разных больных в разных странах, можно проследить его эволюцию примерно так, как лингвисты изучают эволюцию языков. Судя по всему, инфицировавший Маттиа вирусс первой локальной вспышкой этой инфекции в Европе, которая произошла 19 января в Мюнхене, однако цепочку заражения от человека к человеку установить не удалось.

Как были идентифицированы первые случаи COVID-19

В начале декабря несколько человек в городе Ухань в китайской провинции Хубэй заболели после посещения местного рынка морепродуктов. У них были такие симптомы, как кашель, лихорадка и одышка, и даже осложнения, связанные с острым респираторным дистресс-синдромом (ОРДС). Им был поставлен диагноз пневмония, но точная причина не была объяснена. Чем вызвана эта новая вспышка? 

Ученые предприняли действия для выявления этого вируса в декабре после первых случаев. Исследование установило ​​- это совершенно новый вирус, тесно связанный с SARS-подобным коронавирусом китайских летучих мышей.

Цзяньвэй Ванг (Jianwei Wang), ведущий исследователь, утверждает: «Мы установили происхождение коронавируса, которое до сих пор не была известно».

В этом исследовании ученые из Китайской академии медицинских наук, Института биологии патогенов, Больницы дружбы Китай-Япония и Медицинского колледжа Пекинского союза совместно обнаружили и определили новый коронавирус – основной виновник вспышки в Ухане. Исследователи сосредоточились на пяти пациентах, госпитализированных в больницу Цзинь Инь-Тан в Ухани, большинство из которых были работниками рынка морепродуктов. Эти пациенты имели высокую температуру, кашель и другие симптомы, им первоначально был поставлен диагноз пневмония неизвестной этиологии. Состояние некоторых пациентов быстро ухудшалось до ОРДС; один умер.

Ван говорит: «Рентгенография грудной клетки пациентов показала некоторые помутнения и уплотнения, которые типичны для пневмонии. Тем не менее, мы хотели выяснить, что вызвало воспаление легких, и наши последующие эксперименты выявили точную причину — это новый коронавирус, который ранее не был известен».

Для исследования ученые использовали образцы жидкости бронхоальвеолярного лаважа (БАЛ), взятые у пациентов – это процедура, при которой стерильная жидкость переносится в легкие при помощи бронхоскопа и затем собирается для анализа.

Сначала ученые попытались идентифицировать вирус путем секвенирования генома, используя технологию NGS. NGS является предпочтительным методом скрининга для выявления неизвестных патогенов, поскольку обнаруживает и исключает все известные патогенные микроорганизмы в образце. Основываясь на секвенировании ДНК / РНК из образцов жидкости, ученые обнаружили, что большинство вирусов принадлежат семейству коронавируса. Затем ученые сконструировали последовательность генома для нового вируса; эти последовательности были на 99,8-99,9% одинаковыми во всех образцах пациентов, подтверждая, что этот вирус и был причиной заболевания. Кроме того, использовался анализ гомологии, где последовательность генома сравнивали с другими известными последовательностями генома. Филогенетический анализ показал, что последовательности пяти полученных штаммов коронавируса были близки к последовательностям, полученных у летучих мышей, но образовывали отдельные эволюционные ветви. Эти данные ясно указывают на то, что вирус произошел от летучих мышей.

Как была проведена эпидемиологическая проверка первых случаев COVID-19

Иллюстративное фото: pexels.com

Сегодня, 17 ноября, исполняется ровно год с того момента, как был подтвержден первый случай COVID-19. Первый заболевший был выявлен не в декабре, как считалось раньше, а в ноябре, пишет South China Morning Post .

Свежая публикация по теме:

Планируют ли в Казахстане вернуть масочный режим, ответили в Минздраве

Первый подтвержденный случай заболевания COVID-19 в Китае датируется 17 ноября. Согласно правительственным данным, первым человеком, инфицированным новой болезнью, был житель провинции Хубэй в возрасте 55 лет, но "нулевой пациент" еще не подтвержден.

Интервью с информаторами из медицинского сообщества показывают, что китайские врачи осознали, что имеют дело с новой болезнью только в конце декабря.

С этой даты каждый день регистрировалось от одного до пяти новых случаев. К 15 декабря общее количество инфекций составило 27 - первый двузначный ежедневный рост был зарегистрирован 17 декабря - а к 20 декабря общее количество подтвержденных случаев достигло 60.

Сегодня, спустя год, коронавирус нового типа успел проявиться в 55 021 938 случаях. Погибли от нового вируса 1 327 228 человек.

Прошел ровно год, а коронавирус успел оставить отрицательный след практически во всех сферах жизнедеятельности людей.

Первый, кто почувствовал на себе силу COVID-19, стал Китай. Ухань, откуда и пошла пандемия, был закрыт на карантин, людям запрещалось выходить из домов, а на улицах в люди спецодежде распыляли обеззараживающие средства.

Тогда весь мир наблюдал за действиями Китая, не осознавая, что все это придет почти в каждую страну мира. Уже 11 марта ВОЗ объявила, что вспышка COVID-19 может быть охарактеризована как пандемия.

Тогда же Европа стала новым эпицентром коронавируса SARS-CoV-2. Весной особенно пострадала Италия, где регистрировались рекордные числа по заражению и смертности. В Италии ввели карантин, учеба и работа перешли на удаленную форму, развлекательные центры закрылись, были доступны только магазины продуктов и аптеки.

С весны во многих странах были введены ограничения, в том числе и в Казахстане. С тех пор люди поменяли свой образ жизни: стали носить маски в общественных местах, в магазинах продавцы надевают резиновые перчатки, жители страны реже ходить в развлекательные заведения и рестораны. Во время карантина стали популярны онлайн-тренинги, домашние тренировки заменили спортзал.

Коронавирус нового типа очень сильно ударил по экономикам стран всего мира. Всемирный банк предрекал нищету 40 млн жителям азиатских стран.

Ближе к лету новым очагом распространения стали США. До сегодняшнего дня Соединенные Штаты продолжают лидировать по числу зараженных КВИ в мире.

В летнее время некоторые страны позволили открыть свои границы для путешественников, чтобы начать восстанавливать свою экономику.

С наступлением осени в Европе вновь началась волна COVID-19. Франция, Испания и Великобритания стали новыми очагами вируса. Европейские страны ввели жесткие ограничения, которые вызвали обвал фондового рынка.

Целый год ученые всего мира пытаются разработать вакцину против COVID-19. На сегодняшний день известно о высокой эффективности трех вакцин: Pfizer, Спутник V и Moderna.

Тем не менее, вакцина не сможет полностью убить вирус, но сможет помочь его сдерживать.

Ранее мы писали о кризисе COVID-19 в России.

Как был идентифицирован первый источник коронавируса

В ответ на эпидемию чрезвычайно быстро активизировались как научные, так и отраслевые сообщества. В частности, ранняя расшифровка последовательности вирусного генома и последующая публикация кристаллической структуры ключевых поверхностных белков ускорили работу исследователей. Благодаря этому разработка лекарств ведется в довольно быстром темпе.Из-за стремительно ухудшающейся ситуации в мире некоторые препараты старого поколения используются не по прямому назначению, несмотря на низкий уровень доказательности их эффективности. Одним из них являются ингаляции интерферона альфа, а другим – комбинация лопинавира/ритонавира, которая первоначально разрабатывалась для лечения ВИЧ (исследование Дзинь и др., 2020). Кроме того, компания Gilead недавно начала клинические испытания противовирусного препарата ремдесивир, разработанного для терапии вируса Эбола. Исследования ремдесивира вызвали значительный интерес у многих наблюдателей биофармацевтической отрасли и научного сообщества из-за его заметной активности против COVID-19 в лабораторных условиях (исследование Ванга, Цао, Джанга и др., 2020) и возможностей Gilead производить и ускоренно поставлять препарат на рынок в США благодаря имеющейся инфраструктуре. Кроме того, старый противомалярийный дженерик хлорохин показал некоторые положительные результаты среди первой группы пациентов с COVID-19 в Китае (Колсон и др., 2020). Наряду с перепрофилированными препаратами в настоящее время в различных фармацевтических компаниях и научных институтах разрабатывается не менее 22 медицинских препаратов специально для терапии COVID-19. Как и для препаратов против других вирусов, большая часть усилий сосредоточена на поиске ингибиторов протеазы.